| 今天与大家分享一篇来自BMC Genomics的文章：罗非鱼抗水霉感染的转录表达取决于养殖密度，文章引用信息如下:
通过在两种密度下（高密度：6kg/m3；低密度：1.5kg/m3），对罗非鱼感染水霉病的死亡率研究发现，高密度组的死亡率为10.2%（29/285），而低密度组的死亡率为52.1%(38/73)，且幼鱼更易因感染水霉而死亡。密度与鱼体的长度存在显著的相关性（P=0.026），低密度养殖的鱼，平均体长增加。
在鳃组织中，高密度和低密度的两组鱼有175个基因都有较高的表达水平（感染24h和48h）, 且所有受感染的鱼中表达下调的基因主要包括生理过程相关基因，以及MHC II 蛋白。通过差异表达基因分析，发现低密度组的鱼在感染24h后，炎症反应调节基因富集（tnip1, sbno2）；然而，高密度组的鱼在感染24h后增加了一些特定基因的表达，例如免疫球蛋白介导的免疫应答（msh2 , batf ）。此外，T细胞相关的功能基因仅在受感染的高密度养殖鱼中出现，而在感染后的低密度养殖鱼中，MHC II、补体及体液免疫相关基因表达下调。 在皮肤中，低密度鱼在感染24h后，炎性通路相关的基因表达上调，而在高密度鱼中的金属肽酶的活性增强。此外，免疫抑制途径，特别是获得性免疫在两种密度条件下都存在。而在获得性免疫及伤口愈合过程中有明显富集的共表达基因SK1和SK6，与感染状态呈负相关，与养殖密度呈正相关，表明高密度养殖鱼的皮肤中免疫抑制水平较低。
尽管孔雀石绿在防治水霉病方面非常有效，但由于威胁较大，已在2002年在世界范围内被禁止。目前，对于水霉病仍然没有有效的防治措施，因此阐明养殖条件对疾病的易感性至关重要。低密度养殖过程中炎症因子高表达，且免疫抑制因子高表达，导致对水霉的抗性反而降低。而高密度养殖过程中更多的特定免疫因子，包括T细胞免疫因子被激活，且免疫抑制因子水平低，因此反而对水霉的抗性增强。 点评：本文只是对比了每立方6kg和1.5kg两个密度，发现低密度养殖的罗非鱼对水霉反而更敏感。但这并不能说明养殖密度越高越好。对于养殖密度的评估，是与环境的容量、鱼的集群习性、耐低氧能力、抗应激水平等密切相关的，不可一概而论。 |
